נוסף על תמיכה בארגונים חברתיים, הקרן החדשה לישראל מפעילה יחד עם שתי"ל פרויקטים עצמאיים משלה, קואליציות ופורומים, המאגדים בתוכם ארגונים בעלי תחומי עניין קרובים, כדי להגדיל את כוחם ולחזק את יכולתם להשיג את יעדיהם.